Doordat de chloorhexidie aan de tanden blijft kleven heeft het een langdurig effekt.
De nadelen zijn bruinverkleuring, extra tandsteenvorming, en smaakverlies voor zout.

De gangbare concentraties zijn 0,2% 0,12% en 0,05% CHX.

Er is een versie chloorhexidine die geen verkleuring geeft: - Curasept.

Chloorhexidinespoelingen niet langer gebruiken dan 14 dagen.